新バージョンから採用されたこちらのエラーチェック、困った方多いですよね？まあFTP経由でアップするか、filemanagerを利用してアップすればいいわけですが。正直面倒くさい・・・
wp-admin/includes のfile.phpを編集する、というメジャーな解決策がありますが、コアを変更するのは抵抗がある上、バージョンアップのたびに行う必要があるので、あまり現実的でもない・・・
で、気がついたのですが、このエラーは現在「適用」中のテーマファイルを処理する時にだけ、出るのでした・・・まったく同じ内容のテーマをテーマ名を変更して適用してみたところ、適用中のテーマはエラーになりますが、適用外のテーマのPHPファイルは編集・保存が可能でした。
いちいちテーマを切り替えるのも面倒ですが、そもそもある程度出来上がった状態でテーマをアップすることしか想定されていないとすれば、まあ当然か・・・